公司网站费用做账可分为三个步骤：

1、网站建设初始费用做，网站建设初期需要支付域名费用、空间费用、网站制作费用。

2、网站建设补充费用做，根据网站制作的情况，需要对网站进行修改。修改过程会补充网站制作费用。

3、网站运营维护费用，网站上线后，有专业人员日常维护，对维护人员或公司支付运营维护费用。

一、预付网站建设费用：

借：预付账款--网站费

贷：银行存款等

二、网站建成，并支付剩余款：

借：管理费用--网站费(或其他)

贷：预付账款--网站费

贷：银行存款等